Spécialiste technique en génomique - Plateforme d’analyse bio-informatique de séquençage single-cell

Titre d'emploi : Spécialiste technique en génomique - Plateforme d’analyse bio-informatique de séquençage single-cell Type de poste : Personnel non syndiqué Numéro de référence : CNS-24- Direction : Direction de la recherche (DR) Service : Site : Centre de Recherche-CHUSJ Ville ou secteur de l'emploi : Montréal Statut de l’emploi : Temps complet- Temporaire Nombre de jours : Quart de travail : Jour Horaire de travail : 35 heures Catégorie d'emploi : Recherche et enseignement Nombre d'emplois disponibles : 1 Début d'affichage : -02-22 Fin d’affichage : -03-07 Échelle salariale : Description de l’établissement : Le Centre hospitalier universitaire Sainte-Justine est le plus grand centre hospitalier mère-enfant au Canada et l'un des quatre plus importants centres pédiatriques en Amérique.

Associé à l'Université de Montréal, le CHU Sainte-Justine est de loin le plus grand centre de formation en pédiatrie au Québec et un chef de file au Canada.

Chaque jour, ce sont près de 7 personnes engagées spécialistes en soins infirmiers, en réadaptation physique, en santé psychosociale, en recherche et en administration, médecins, dentistes, pharmaciennes et pharmaciens, stagiaires et bénévoles qui, inspirées par une tradition d’innovation, collaborent afin de transformer la vie de générations.

Description du poste : Projet

La plateforme en bio-informatique du séquençage en cellules uniques ( single-cell ) également nommée Méta-Plateforme de Génomique Intégrée (MPGI).

La MPGI propose une offre de services articulée autour de deux volets étroitement connectés : 1) le Volet Génomique Unicellulaire (VGU) et 2) le Volet séquençage Nanopore (VNano).

La MPGI est une plateforme scientifique de recherche de la Direction de la recherche du CHU Sainte-Justine (CHUSJ) en pleine expansion.

La plateforme dessert principalement les besoins des chercheurs en hémato-oncologie pédiatrique, mais aussi d’autres domaines et axes de recherche de plusieurs institutions pour répondre à leurs besoins en matière de technologies innovantes et d’analyses avancées.

Cette plateforme est à la recherche d’un spécialiste technique en génomique, dont le mandat principal sera d’épauler les chercheurs dans la préparation et exécution des projets des deux volets de la plateforme et dans le développement du volet de séquençage et d’analyses nanopores associé aux services de génomique unicellulaire offerts aux chercheurs pour accélérer le diagnostic rapide, précis et rentable des cancers pédiatriques basé sur différentes approches telles que le profilage d'expression génique (transcriptomique) en temps réel et l’analyse du génome complet.

La création d’un nouveau poste de spécialiste technique en génomique de la plateforme est une opportunité de venir relever de nouveaux défis au sein de notre institution.

Description du poste

Sous l’autorité hiérarchique de la Cheffe des plateformes scientifiques et sous la supervision immédiate du responsable de la plateforme, les tâches et responsabilités principales du spécialiste technique en génomique seront :

• Recevoir, enregistrer et traiter les échantillons biologiques (e.g. sang, tissus, salive, cellules mononuclées du sang périphérique (PBMCs), etc.);
• Réaliser des extractions d’acides nucléiques (ADN, ARN) et effectuer le contrôle de qualité à partir de biospécimens variés pour la génération subséquente de données multi-omiques;
• Réaliser des techniques de biologie moléculaire telles que la préparation de librairies de séquençage haut débit pour faire du séquençage par nanopores et de transcriptomique de troisième génération;
• Exécuter différents types de protocoles de biologie moléculaire permettant la réalisation d’expériences de génomique unicellulaire et de séquençage avec la technologie Nanopore, incluant certaines techniques histologiques de base et d’imagerie tissulaire;
• Évaluer la qualité des préparations unicellulaires pour les expériences de génomique unicellulaire;
• Participer au développement de nouveaux protocoles de génomique unicellulaire et de séquençage par nanopores en collaboration avec l’équipe de la plateforme et ses directeurs scientifiques;
• Participer à la rédaction de devis avec le spécialiste en analyses bio-informatiques pour un nouveau projet et la mise en place de la grille tarifaire des services offerts à la plateforme;
• Saisir des données associées aux échantillons (cliniques, biologiques) dans le logiciel de gestion des échantillons, maintenir l’inventaire, l’archivage et le suivi dans le cahier de laboratoire électronique et / ou le système de gestion de l’information indiqué pour maintenir les standards de qualité de la plateforme;
• Produire des rapports de suivis des projets ou tout autre document pertinent demandés par les équipes de recherche;
• Interagir avec le personnel de recherche à chacune des étapes des projets et contribuer à la formation;
• Veiller à la disponibilité et au bon état des réserves des consommables périssables et non périssables et assurer le suivi du budget disponible;
• Réceptionner des livraisons de matériel de laboratoire;
• Participer à l’entretien du poste de travail et des équipements;
• Toute autre tâche connexe. Exigences : L’ensemble de ces tâches sont décrites dans des procédures normalisées de fonctionnement que le spécialiste technique en génomique doit être capable de comprendre, d’appliquer, de critiquer et de mettre à jour au besoin.

Aptitudes et qualités requises

• Étant amené à travailler dans un centre hospitalier universitaire pédiatrique, le spécialiste technique doit être sensible à l’éthique en recherche sur l’enfant et l’adolescent.
• Par ailleurs, le matériel sur lequel il travaillera étant précieux, il doit être minutieux, observateur et organisé;
• Le spécialiste technique doit pouvoir être capable de s’adapter, de faire face à l’imprévu, d’avoir une excellente capacité de gérer son temps et de prioriser.

Formation et exigences

• Diplôme de deuxième cycle en sciences biomédicales, en biochimie, en biologie moléculaire, biotechnologie, médecine expérimentale ou l’équivalent pertinent.
• Un baccalauréat (B.Sc.) avec plus de deux années d’expérience dans un environnement biomédical ou biotechnologique sera également considéré;
• Proactif et capable de travailler de façon indépendante;
• Flexibilité, capacité à travailler sous pression et à gérer efficacement les priorités;
• Critique de la qualité et du type de résultat attendu et capacité d’interprétation et d’optimisation des résultats;
• Bonnes habiletés interpersonnelles, excellente communication et excellent service à la clientèle;
• Une expérience pertinente dans un laboratoire de recherche est demandée (connaissance des BPL);
• Bonne connaissance du français et de l’anglais. Bien que notre milieu de travail soit francophone, la communication scientifique se fait de manière prépondérante en anglais.

Conditions d’emploi

Il s’agit d’un poste à durée indéterminée, à temps complet (35hrs / semaine), non syndiqué, avec période de probation d’un an, faisant partie intégrante de l’équipe de la Direction de la recherche.

La rémunération varie entre 47 $ et 79 $. Les autres conditions sont établies en fonction des normes en vigueur dans l’établissement.

Date d’entrée en fonction : Immédiate

Nous tenons à préciser que les candidats étrangers devront avoir un permis de travail valide pour le CHU Sainte-Justine. Tout permis de travail ayant la condition suivante ne sera pas éligible : Pas autorisé à exercer un emploi relié aux soins des enfants, à l'enseignement au primaire ou au secondaire, au domaine de la santé .

Si ce poste vous intéresse, veuillez utiliser notre site de recrutement pour postuler en ligne et soumettre votre CV, ainsi qu’une lettre d’intérêt : Remarques : Le genre masculin est utilisé sans discrimination et dans le seul but d’alléger le texte.

Le CHU Sainte-Justine souscrit au principe d'accès à l'égalité en emploi et invite les femmes, les membres des minorités visibles et des minorités ethniques, les personnes handicapées et les Autochtones à poser leur candidature.

Nous vous serions gré de nous faire part de tout handicap qui nécessiterait un aménagement technique et physique adapté à votre situation lors du processus de sélection.

Soyez assuré que nous traiterons cette information avec confidentialité. Autres avantages : FAIRE CARRIÈRE CHEZ NOUS, C’EST :

• Contribuer à une mission humaine qui a pour but d’améliorer la santé des mères et des enfants du Québec;
• S’investir avec une équipe de travail innovatrice, motivée par des projets en constante évolution;
• Avoir la possibilité de se réaliser à travers des défis stimulants;
• S’offrir une carrière à la hauteur de ses compétences dans un milieu constamment en mouvement;
• Évoluer dans une organisation qui vise l’amélioration continue;
• Se réaliser professionnellement grâce aux multiples possibilités de développement.
Il y a plus de 30 jours