Maitrise à l’Université de Montréal – Campus de Saint Hyacinthe – Option microbiologie

Description

Il est reconnu que l’antibiorésistance (ATBR) est l'un des plus grands défis à venir. Ces dernières années, plusieurs organisations internationales (OMS, FAO et OMSA) et plusieurs pays ont élaboré des stratégies pour lutter contre l’ATBR. Le Québec (Canada) a adopté une nouvelle législation en février , pour limiter l'utilisation des antimicrobiens de catégorie I selon la classification de Santé Canada chez les animaux de production. La mise en œuvre de cette interdiction limitera potentiellement la résistance aux antimicrobiens chez les animaux, l'environnement et les êtres humains au Québec. Cependant, des preuves solides sont nécessaires pour déterminer l'effet exact de ce type d'action, à court, moyen et long terme.

Grace à l’analyse métagénomique de fumier prélevé sur des fermes laitières avant et après la règlementation (déjà effectués), cette étude va permettre d’évaluer l'effet du règlement sur le résistome (ensemble des gènes de résistance), sur le mobilome (ensemble des éléments génétiques mobiles) mais aussi sur le risque que l'ATBR chez les bovins laitiers représente pour la santé publique.

Le pipeline bio-informatique est déjà conçu et l’analyse des séquences brutes est en cours. L’étudiant sera impliqué dans l’interprétation des résultats de bio-informatiques.

Profile

License en microbiologie avec un intérêt pour la bio-informatique.

Les étudiant(e)s avec une License en bio-informatique avec un intérêt pour la microbiologie (et en particulier la génomique) sont aussi invité(e)s à présenter leur candidature.

Connaissance de la langue française ou anglaise requise (oral et écrit).

Starting date

• 01-01